在我國的生活飲用水衛生學評價中，對于檢測的微生物指標是有著嚴格的規定要求，就大腸菌群、耐熱大腸菌群、大腸埃希菌這些作為指標菌。目前最為傳統的方法就是多管發酵法，這種方法的檢測周期是比較長，整個實驗操作步驟是比較多的，而且不能對生活飲用水的衛生學做出快速的評價，那比如在發生自然災害的情況下，對于水質的檢測是需要用微生物來做為指標的。這是為了保證災區人民群眾飲水的基本安全保障，所以傳統方法就不太適合，那最新的酶底物法檢測系統是可以快速檢測水中微生物，能夠一定限度的保證飲水安全。

酶底物法 （ enzyme substrate technique）的原理是 ：利用大腸菌群細菌能產生β2半乳糖苷酶 （β2D2galactosidase）分解 ON 2PG （O rtho2 nitrophenyl2β2D2galactopyranoside ） 使培養液呈黃色 ,檢測水樣中是否含有大腸菌群。利用大腸埃希菌產生 β2葡萄 糖 醛 酸 酶 （ β2glucuronidase ） 分 解 MUG （ 42 methyl2umbelliferyl2β2D2glucuronide）使培養液在波長 366 nm紫外光下產生藍色熒光 , 檢測水樣中是否含有大腸埃希菌。酶底物法有商品化試劑供應 ,實驗操作簡便 ,無需確認試驗 ,可同時檢測水樣中大腸菌群和大腸埃希菌。如果改變培養溫度 ,還可檢測耐熱大腸菌群。該方法檢測周期短 , 18 ～24 h 即可報告結果。可見該方法大的特點是節省了時間和人力。

酶底物法應用的優勢：

1.檢測數據精確

酶底物法運用程控定量封口機和定量封口盤檢測水質，檢測出來的結果精準度高，實驗結果更有公正性，而且針對于檢測結果不需要二次驗證，更高效。

2.簡單快捷

運用程控定量封口機檢測，檢測時間不超過24小時，通過簡單的操作指導后就能夠上手操作，不需要對玻璃器皿進行清洗，減輕工作量。更適合與大量樣品的檢測。